Maakunnan yhteistyöryhmien asemaa rakennerahastoista rahoitettavien hankkeiden valinnassa vahvistetaan. Euroopan aluekehitysrahaston ja Euroopan sosiaalirahaston tukirahoitus tulee sisältymään yhteen ohjelma-asiakirjaan, jonka valmistelua alueilla koordinoivat maakuntien liitot. Työ- ja elinkeinoministeriö vastaa ohjelman koonnista ja yhteensovituksesta. Hankkeiden rahoituksesta vastaavat maakuntien liitot ja ELY -keskukset, poikkeustapauksissa päätöksiä tehdään myös ministeriöissä. Rakennerahasto-ohjelman 2014-2020 valmistelu käynnistetään tänä keväänä.
Tehtyjen linjausten valossa maakuntien liittojen asema säilyy v. 2014 käynnistyvällä rakennerahastokaudella entisellään rahoituksesta päätettäessä ja asema jopa vahvistuu, kun Maakunnan yhteistyöryhmän roolia vahvistetaan. Maakuntien liittojen tulevaisuuteen tulee vaikuttamaan meneillään oleva kuntauudistus. Maakuntien liittojen hallitusten puheenjohtajat luovuttivat kannanoton maakuntien tulevaisuudesta ministeri Virkkuselle 9.3.2012. Kannanotossa maakunnat ilmaisevat valmiutensa tehtäväkenttänsä laajentamiseen.